Philogénie du virus respiratoire syncytial bovin : étude comparative du génome de trois pathotypes

Abstract

Comme tous les virus à ARN, les virus respiratoires syncytial humain (VRSH) et bovin (VRSB) possèdent une variabilité génétique qui leur permet d'évoluer rapidement. Si de nombreuses séquences génomiques du VRSH sont disponibles, une seule séquence du génome du VRSB a été publiée, sur une souche de laboratoire. Dans cette étude, nous avons déterminé la séquence génomique complète de trois nouvelles souches de VRSB récemment isolées en France et n'ayant pas subi de modifications par passages en cultures cellulaires. Nos résultats montrent que les mutations sont majoritairement observées sur les gènes G et SH. Les études phylogénétiques, sur le génome complet et les gènes N, F, et G, indiquent que deux souches sont fortement apparentées entre elles (>98% d'identité nucléotidique) et avec les isolats récemment identifiés en France. La 3e souche VRSB 3761 montre un degré de divergence plus important, elle appartient à un groupe génétique différent, contenant majoritairement des souches américaines. Cette souche 3761 apparait plus virulente que les deux autres en modèle d'infection expérimentale chez le veau.