Étude du virus responsable de la maladie du sommeil de la carpe‎ : analyses épidémiologiques et moléculaires

Abstract

Le Carp edema virus (CEV) est responsable de la maladie du sommeil de la carpe (Koi sleepy disease, KSD). Cette maladie, découverte au Japon dans les années 1970, touche exclusivement les carpes Cyprinus carpioet entraine des mortalités massives à travers le monde.Nous avons collecté nos échantillons à la Pisciculture d’Estalens (Gers –France)entre 2017 et 2020.Lors de l’importation de carpes Koï du Japon de 2019, leCEV a été détecté dans 76 % des poches de transport. La durée d’excrétion post-importation étaitvariable mais pouvaitatteindre deux semaines dans des lots asymptomatiques et un mois dans des lots symptomatiques. Les essais de réplication sur culture primaire de cellules embryonnaires et sur embryons de carpe ont été sans succès.Nous avons séquencé pour la première fois la zone intergénique P4a P4b. Les analyses phylogénétiques positionnent nos échantillons dans le génogroupe II et le CEV parmi les Chordopoxvirinae, à proximité du Salmon gill poxvirus.