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Étude génétique d’un variant de pigmentation du plumage de Gallus gallus : Columbian Restriction

Guilloton, Chloé. Étude génétique d’un variant de pigmentation du plumage de Gallus gallus : Columbian Restriction. Thèse d'exercice, Médecine vétérinaire, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse – ENVT, 2018, 177 p.

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Abstract

Un des variants de pigmentation du plumage de Gallus gallus, Columbian Restriction, entraîne une suppression du dichromatisme sexuel ainsi qu’une restriction de l’étendue de noir. Des travaux préliminaires conduits au sein de l’UMR GABI, à l’INRA de Jouy-en-Josas, ont permis de d’identifier une région de 1,47 Mb située sur le chromosome 2 portant probablement la mutation responsable. Une étude d’association a été réalisée lors de cette thèse pour restreindre la taille de la région candidate et déterminer des gènes candidats. La quantification de l’expression de ces gènes a été réalisée. En complément, les données issues du séquençage du génome complet d’individus d’une race porteuse de la mutation et de races non porteuses ont été comparées afin d’identifier le variant causal. Au final, une région candidate de 300 kb a été déterminée et six gènes candidats isolés. L’étude de leur niveau d’expression n’a cependant pas montré d’association avec le phénotype Columbian Restriction. Vingt-huit variants génomiques spécifiques de la race porteuse de la mutation ont été identifiés grâce aux données de séquençage complet.

Item Type:Thèse d'exercice
Uncontrolled Keywords:
Institution:Université de Toulouse > Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse - ENVT (FRANCE)
Université de Toulouse > Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE)
Université de Toulouse > Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE)
Research Director:
Ducos, Alain
Statistics:download
Deposited On:06 Feb 2020 10:44

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